在遥远未来的星球上，半空之中漂浮着被称为“知识之箱”的巨大数据空间，那里保存着无数被数字化的人类、时间与世界。少女杜娅尔与多萝茜是负责清除侵蚀箱内世界的“病毒”的净化者，她们穿梭于各个濒临崩溃的虚拟世界，执行着永无止境的清理任务。某日，她们在战斗中意外发现一名被病毒包裹的少女莉莫。莉莫失去记忆，却拥有与病毒对抗的奇异力量。为了弄清她的来历，两人将她带在身边，一同踏上旅程。随着深入“知识之箱”的核心，莉莫逐渐回忆起自己曾是人类，而病毒正是人类情感与怨念的具象化产物。在一次次战斗中，杜娅尔与多萝茜也开始质疑自身存在的意义——她们究竟是守护者，还是同样被数据囚禁的幽灵？当最终的真相揭晓，莉莫必须面对自己与病毒之间无法割舍的联系，而两位少女也将做出关乎世界存亡的抉择。这是一个关于记忆、情感与存在的故事，在绚烂的光影与破碎的世界中，她们用战斗寻找着属于自己的答案。