2010年，曾经的小学生们已成长为22岁的青年，八神太一与石田大和等人各自踏上不同的人生道路，昔日的冒险似乎已成为遥远的记忆。然而，数码世界再度发生异变，神秘研究者梅诺亚·贝尔奇（松冈茉优 配音）突然出现，并向他们揭示了一个残酷的真相：由于“被选召的孩子们”已经长大，他们与搭档数码宝贝之间的羁绊即将因时间的流逝而消失，届时数码宝贝将不复存在。面对这无法逃避的命运，太一与亚古兽、大和与加布兽必须做出艰难抉择。与此同时，全球各地接连发生数码宝贝袭击人类的事件，背后隐藏着更大的阴谋。为了守护珍视的伙伴与世界的和平，他们必须再次携手，展开一场关乎离别与成长的最终战斗。在这场最后的进化中，他们不仅要对抗强大的敌人，更要直面与搭档告别的那一刻，书写属于数码宝贝系列最动人的终章。