在《X战警：进化》第一季中，故事设定于现代高中背景，聚焦于X教授查尔斯·泽维尔与他的变种人学生们。查尔斯拥有强大的心灵感应能力，他坚信变种人与人类可以和平共处，因此创办了泽维尔天才青少年学校，秘密训练一群初露锋芒的年轻变种人。本季核心人物包括拥有强大光学冲击能力的斯科特·萨默斯（镭射眼）、具备心灵感应与念动力的琴·格雷、能操控天气的奥罗罗·门罗（暴风女），以及拥有野兽般敏捷与力量的汉克·麦考伊（野兽）。他们不仅要适应高中生活，还要学会控制自己突发的超能力，并应对来自外界的敌意与误解。与此同时，万磁王埃里克·兰谢尔以更为激进的方式招募变种人，主张用力量对抗人类。他的阵营中包括能操控磁场的北极星、能改变外形的魔形女等，与X战警形成鲜明对立。随着一桩桩事件升级，年轻变种人们被迫在两种理念间做出选择，而X教授则试图以教育与理解化解仇恨。本季通过多线叙事展现了变种人觉醒的挣扎、团队协作的磨合，以及人性与歧视的复杂议题。每一集都在动作冒险中融入角色成长，为后续的进化之路奠定基础。