故事延续前作，时间已过十余年。杰克·萨利与奈蒂莉在潘多拉星球上建立了温馨的家庭，育有儿女，过着看似平静的生活。然而，人类的再度入侵打破了安宁，天空人的战舰重返潘多拉，誓要摧毁这片土地，更将复仇的矛头直指杰克一家。为保护家人，杰克决定放弃森林部落的领袖地位，带领全家远走他乡，前往潘多拉的海洋区域，寻求神秘的梅卡伊纳部落庇护。初到水世界，孩子们必须适应全新的水下生活，学习与海洋生物沟通，掌握驾驭水之道的能力。尤其是次子洛阿克，因身份尴尬备受排挤，却意外与一头被遗弃的图鲲结下深厚羁绊。与此同时，人类军官夸里奇上校以阿凡达之躯重生，带着刻骨的仇恨追杀杰克。他不仅掌握了潘多拉的生态弱点，更利用高科技手段猎杀图鲲，企图彻底摧毁海洋部落的生存根基。面对强大的敌人，杰克必须在部落传统与家人安全之间做出抉择，而奈蒂莉则展现出前所未有的战斗意志，誓死守护骨肉至亲。在一场场惊心动魄的海底大战中，萨利一家深刻领悟了“水之道”的真谛——水连接万物，情感亦如水流般绵延不绝。他们最终团结海洋部落，共同抵御外敌，用牺牲与爱守护了家园，也完成了从逃避到反击的成长蜕变。